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科研服務

真核有參轉錄組測序

常見問題

  • 簡述真核(he)轉錄組常(chang)規建庫流程

    1)通(tong)過(guo)磁珠和(he)mRNA的polyA結構將mRNA分(fen)離出來;

    2)mRNA片段化;

    3)mRNA反轉錄為雙鏈(lian)結構(gou),第二鏈(lian)cDNA合成(cheng)時,其中的(de)堿(jian)基T,被替換成(cheng)U,從(cong)而達到鏈(lian)特異性文庫的(de)目的(de);

    4)5’末(mo)端修復(fu)、3’末(mo)端加A;

    5)加接頭;

    6)選擇特異長度回(hui)收,一般為300bp;

    7)PCR;

    8)上機測序。


  • 如何對得到的數目較多的差異基因進行后期驗證?

    首先根據GO或者KEGG富集結果,或者客戶關注(zhu)的(de)(de)基因,選取有代表性的(de)(de)進行qRT-RCR驗證。然后(hou)根據RPKM值,選擇RPKM值差異倍數答(da),同(tong)時p值小的(de)(de)基因進行qRT-RCR驗證。