分析項目 | 類(lei)別(bie) | 分析 | 備注 | |
1. | 原始數據整理、過濾及質量(liang)評估 | A | √ | |
2. | 參考基因組注釋整(zheng)理(li)與統計 | A | √ | |
3. | A | √ | ||
4. | 基因(yin)表(biao)達量統計 | A | √ | |
5. | A | √ | ||
6. | A | √ | ||
7. | A | 內部生物學重復之間 | ||
8. | A | 樣(yang)品數 ≥3 | ||
9. | 基因表達差(cha)異分析 | A | √ | 樣品數≥2 |
10. | A | 基因(yin)或(huo)樣(yang)品≥3 | ||
11. | PCA分析 | A | √ | |
12. | 表達差異基因(yin)GO富(fu)集(ji)分析 | A | √ | |
13. | 表達差異基因KEGG通路(lu)富集分析 | A | √ | |
14. | 表達差(cha)異基(ji)因聚類分(fen)析 | A | √ | |
15. | cSNP分析 | A | √ | |
16. | 可變剪(jian)切(qie)分析 | A | √ | |
17. | UTR分析 | A | √ | |
18. | 新轉錄位(wei)點(dian)分析 | A | √ | |
19. | B | 實驗分(fen)組(zu)≥3 | ||
20. | B | 提供客戶軟件及使(shi)用方法(fa) | ||
21. | B | 需要有生物學重復(fu) | ||
22. | B | 需要有(you)生物學重復 | ||
23. | B | √ | 客戶提供關注蛋白 | |
24. | B | 要(yao)求基(ji)因組完成圖(tu) | ||
25. | B | 樣(yang)品數≥20 |
圖1 樣(yang)品相關(guan)性檢驗
圖2 基(ji)因差異表達火山圖
圖3 不同組間的差異(yi)
圖4 基因有向無環(huan)圖
