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科研服務

全長轉錄組測序

測序(xu)樣本(ben)要(yao)求(qiu)


樣本
測序樣(yang)本要求

動植物組(zu)織

組(zu)織(zhi)鮮重 0.2g,只記有效組(zu)織(zhi)細胞(bao)重量

真菌(jun)

菌(jun)體、菌(jun)絲、孢子粉(fen)等(deng)濕重 0.2g

動植物和(he)酵母細胞

5-10x106個細胞

新鮮血(xue)液(抗凝)

250μl

總RNA

總量(liang)>5μg/文庫,C>300ng/ul,RIN≥8


序號
測序分析項目

1

原始數據整理、過濾(lv)及質量評估

2

插入片段質量控制

3

轉錄本分類

4

轉錄本聚類與(yu)校正(zheng)

5

參考基因(yin)組注釋整理與統計

6

比對(dui)結果(guo)統計

7

功能注釋(GO、KEGG等(deng))

8

融合基因分析

9

基(ji)因結構優化

10

SNP分析

11

可(ke)變剪切分(fen)析

12

UTR分析(xi)

13

新(xin)轉錄(lu)位點分析

14

基因表達(da)量統計(ji)

15

基因表達差異分(fen)析

16

表達差(cha)異(yi)基(ji)因(yin)GO富集(ji)分析

17

表達差異基因(yin)KEGG通路富集分析

18

表達差異基因聚類分(fen)析